蛋白质组学详细

SILAC定量蛋白质组学 > SILAC定量蛋白质组学

    SILAC定量蛋白质组学

                         

    SILAC标记定量


            SILAC技术是由美国Thermo Fisher公司研发的一种多肽体内标记技术。该技术是将重型和轻型13C或15N同位素分别标记在L-赖氨酸和L-精氨酸两种必需氨基酸上。细胞经必需氨基酸培养5-6代后,所有蛋白质均会被标记上同位素。将不同处理因素刺激后的细胞蛋白进行质谱分析,在一级谱图中根据同位素峰型的面积大小进行丰度比对,二级谱图行肽段序列鉴定,即可得到蛋白质组的定性和定量数据。

     

            凭借体内标记的优势, SILAC标记更好地保留了蛋白质的各种生物学特性,而且标记效果没有偏性。因此,该技术在涉及到蛋白质修饰、蛋白质与蛋白质相互作用、蛋白质与DNA/RNA相互作用等研究中的应用尤为广泛。

    A1.png

                   

    主要仪器设备

     

    Q Exactive Plus 组合型四极杆 Orbitrap 质谱仪

    分辨率:140000 at m/z 200,可选 280000 at m/z 200
    扫描速率:最高12 HZ
    质量数范围:m/z 50- 6000 
    应用范围:高通量蛋白质鉴定——复杂样品
                     定量蛋白质组学——iTRAQ/TMT定量
                     修饰蛋白组分析


    Q-Exactive-Plus-with-UltiMate-RSLC-Front.jpg-650.jpg


    样品要求

     

    YY.jpg

                    

    应用方向


                       
     
      发病机理研究

                          药物靶点研究

                          蛋白质修饰研究                

                          蛋白质与分子互作研究                

                          特殊功能蛋白质筛选

    相关文献

    1. McHugh C A, et al. The Xist lncRNA interacts directly with SHARP to silence transcription through HDAC3. Nature, 2015, 521(7551): 232-236.

    2. Jiang N, et al. In vivo quantitative phosphoproteomic profiling identifies novel regulators of castration-resistant prostate cancer growth. Oncogene, 2015, 34(21): 2764-2776.

    3. Ong S E, et al. A practical recipe for stable isotope labeling by amino acids in cell culture (SILAC). Nat Protoc , 2006, 1(6): 2650-2660.